Kashiwa.R_7


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第7回 Kashiwa.R バイオ実験系ラボ支援回

千葉県柏周辺のRユーザーによる勉強会です.(「周辺」の定義は個々人の解釈に準じます…)
今回は理科大野田キャンパスに出張して開催する事になりました.

特設サイト
Google Site

普段実験をメインでやっている方でも、Rを覚える事でこんなメリットがあります.
  • Web上のデータを100個ダウンロードしないといけない... → Rならコマンド数行でできます!
  • もっとかっこいいFig書きたいな... → Rならできます!
  • データが大きくてExcelで開けない... → Rならできます!
  • あの論文に載ってた最新の統計手法って... → Rのパッケージになってます!
  • 次世代シーケンサーの解析ってどうやるんだろ... → みんなR使ってます!

当日発表で利用されたスライド、プログラムは特設サイトからダウンロードできます.


日時場所


内容

発表時間の目安は一人20分程度です.
質問も随時受け付けます.

発表者: tsutatsuta
タイトル: Kashiwa.Rについて
時間: 20分
概要: Kashiwa.Rという集まりとこれまでの活動について

発表者: wakuteka
タイトル: Rの基本
時間: 20分
概要: Rで何ができるか

発表者: fukunagaTsu
タイトル: Rでプロット
時間: 20分
概要: 論文に掲載されたFigureをRで再現

発表者: gggtta
タイトル: Rでデータ取得自動化
時間: 20分
概要: Web-APIを利用したデータダウンロードの自動化

発表者: Med_KU
タイトル: 比較・検定・多重検定補正
時間: 20分
概要: p値、t検定、Bonferroni補正

発表者: antiplastics
タイトル: DNAマイクロアレイの解析と多重検定補正
時間: 20分
概要: 発現変動遺伝子検出手法, Benjamini-Hochberg法、Q-value法, LocalFDR法

発表者: yuifu
タイトル: RでできるRNA-seq, ChIP-seq解析
時間: 20分
概要: 次世代シーケンサーを用いた解析例

発表者: antiplastics
タイトル: 遺伝子のアノテーション付加
時間: 20分
概要: 遺伝子リストから様々な機能情報をデータベースから収集


懇親会

  • 終了後,食堂(みなも)で懇親会 18:00 - 20:00
  • 参加費2000円程度を予定しております
  • 懇親会にも参加される方は、kashiwa.r.wet@aol.jpに所属とお名前を送ってください
  • 幹事: antiplastics

主催

総合教育研究機構情報教育センターバイオインフォマティクス教育部門

共催

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